F-35的機體蒙皮上覆蓋了一層由洛克希德和3M公司共同研制開發(fā)的涂料，這種新涂層與傳統(tǒng)飛機上所漆的涂料有很大差異。嚴格來說這并不是一種涂料，而是一種用聚合材料制造的薄層，可直接粘貼覆蓋于蒙皮上，所以就不需要在蒙皮進行噴漆。這樣做最大的好處就是可以節(jié)省經費，而且還可以減輕飛機因噴漆而附加的重量，這項措施至少可以使飛機在全壽命周期內節(jié)省300公斤涂料。新式聚合物薄層已在F-16上通過可行性測試，當飛行速度到達1.8馬赫時，此薄層依然完好如初。不過根據(jù)現(xiàn)在的消息，F(xiàn)-35仍采用傳統(tǒng)的噴涂技術。據(jù)韓五記說，F(xiàn)-35所用的隱身涂料具有更好的耐用性，也更便于維護。而且有一定的冗余設計，即涂層損傷在一定范圍內，隱身效果仍然好于軍方要求。F-35的涂層由噴涂機器人完成，具有相當高的平整度。據(jù)稱這一技術非常先進，為了防止技術擴散，美國甚至在考慮讓海外組裝的F-35飛回美國進行最后的噴涂工作。美國空軍在考慮為F-22換用F-35的隱身涂料，據(jù)稱僅需要適量的修改，F(xiàn)-35的涂料就可以滿足F-22高空、高速飛行下的要求，且不降低其隱身性能。