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軍醫(yī)科普貼!什么是長鏈非編碼RNA

來源:解放軍第306醫(yī)院作者:沈小英責(zé)任編輯:張曦晛
2016-02-24 09:17

長鏈非編碼RNA (Long noncoding RNAs, lncRNA)是一類無或少有蛋白質(zhì)編碼能力的復(fù)雜長鏈非編碼RNA,其在多數(shù)真核生物基因組被轉(zhuǎn)錄。目前,人們對lncRNA的認(rèn)識還處在初級階段,最初被認(rèn)為是基因組轉(zhuǎn)錄的“噪音”,是RNA聚合酶II轉(zhuǎn)錄的副產(chǎn)物,不具有生物學(xué)功能。然而,近年來的研究表明,lncRNA參與了X染色體沉默,基因組印記以及染色質(zhì)修飾,轉(zhuǎn)錄激活,轉(zhuǎn)錄干擾,核內(nèi)運輸?shù)榷喾N重要的調(diào)控過程,lncRNA的這些調(diào)控作用也開始引起人們廣泛的關(guān)注。RNA不僅僅只承擔(dān)遺傳信息中間載體的輔助性角色,而是更多地承擔(dān)了各種調(diào)控功能。ncRNA在發(fā)育和基因表達(dá)中發(fā)揮的復(fù)雜精確的調(diào)控功能極大地解釋了基因組復(fù)雜性之難題,同時也為人們從基因表達(dá)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的維度來認(rèn)識生命體的復(fù)雜性開啟新的天地?,F(xiàn)在大部分研究集中于短 RNA如, microRNA,piRNA等一些 ncRNA 生物生成機制和調(diào)控通路,甚至在一些人類復(fù)雜疾病中的功能,但是這都只是冰山一角。哺乳動物基因組序列中4%~9%的序列產(chǎn)生的轉(zhuǎn)錄本是lncRNA(相應(yīng)的蛋白編碼RNA的比例是1%),雖然近年來關(guān)于lncRNA的研究進(jìn)展迅猛,但是絕大部分的lncRNA的功能仍然是不清楚的,隨著研究的推進(jìn),各類 lncRNA 的大量發(fā)現(xiàn),lncRNA 的研究將是 RNA 基因組研究非常吸引人的一個方向,使人們逐漸認(rèn)識到基因組存在人類知之甚少的“暗物質(zhì)”。

lncRNA通常較長,具有mRNA樣結(jié)構(gòu),經(jīng)過剪接,具有polyA尾巴與啟動子結(jié)構(gòu),分化過程中有動態(tài)的表達(dá)與不同的剪接方式。lncRNA啟動子同樣可以結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子,如Oct3/4,Nanog,CREB,Sp1, c-myc,Sox2與p53,局部染色質(zhì)組蛋白同樣具有特征性的修飾方式與結(jié)構(gòu)特征。大多數(shù)的lncRNA在組織分化發(fā)育過程中,都具有明顯的時空表達(dá)特異性,如有人針對小鼠的1300個lncRNA進(jìn)行研究,發(fā)現(xiàn)在腦組織中的不同部位,lncRNA具有不同的表達(dá)模式。在腫瘤與其他疾病中有特征性的表達(dá)方式。序列上保守性較低,只有約12%的lncRNA可在人類之外的其他生物中找到。

長鏈非編碼RNA的作用機制非常復(fù)雜,至今尚未完全清楚。根據(jù)目前的研究,lncRNA的作用機制主要有以下幾種:編碼蛋白的基因上游啟動子區(qū)轉(zhuǎn)錄,干擾下游基因的表達(dá);抑制RNA聚合酶II或者介導(dǎo)染色質(zhì)重構(gòu)以及組蛋白修飾,影響下游基因的表達(dá);與編碼蛋白基因的轉(zhuǎn)錄本形成互補雙鏈,干擾mRNA的剪切,形成不同的剪切形式;與編碼蛋白基因的轉(zhuǎn)錄本形成互補雙鏈,在Dicer酶的作用下產(chǎn)生內(nèi)源性siRNA;與特定蛋白質(zhì)結(jié)合,lncRNA轉(zhuǎn)錄本可調(diào)節(jié)相應(yīng)蛋白的活性;作為結(jié)構(gòu)組分與蛋白質(zhì)形成核酸蛋白質(zhì)復(fù)合體;結(jié)合到特定蛋白質(zhì)上,改變該蛋白質(zhì)的細(xì)胞定位;作為小分子RNA(如miRNA、piRNA)的前體分子。(沈小英 解放軍第306醫(yī)院病理科)

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