由于連年的軍閥混戰(zhàn)，導(dǎo)致時局動蕩，航校的發(fā)展也深受影響，短短數(shù)年間，五易首長，以至于正常的教學(xué)和訓(xùn)練工作經(jīng)常被打斷，到1925年第四期學(xué)員畢業(yè)后，南苑航空學(xué)校已經(jīng)到了難以為繼的地步，無力繼續(xù)招生。1928年5月，隨著北洋政府的消亡，南苑航空學(xué)校終被撤銷。在辦校的15年時間里，累計招生四期，159名學(xué)員學(xué)成畢業(yè)，加上8名未畢業(yè)就被提前聘用的學(xué)員，共計培養(yǎng)了167名飛行人才，這些學(xué)員，成了日后中國航空事業(yè)的骨干，其中有的還成為新中國航空事業(yè)的先驅(qū)。